رای هر جه بهتر شدن کمیت و کیفیت ثبت در ابتدا بایستی تعریف دقیقی از بیماری های دستگاه گوارش فوقانی، تحتانی، کبدی و پروسیجرهای مرتبط با آنها براساس معیارهای استاندارد صورت پذیرد. و کلیه مستندات، مدارک و نتایج مربوطه در بایگانی فرد محفوظ شود تا در مواقع لزوم بتوان به آنها مراجعه نمود. سپس فرمی واحد و استانداردی را که بر اساس نوع پروسیجر تهیه شده است توسط پزشک معالج تکمیل شده و سپس برای ثبت در سامانه ارسال میگردد. این امکان بایستی وجود داشته باشد تا بشکل همزمان اطلاعات ثبت شده در مرکز اصلی ثبت برای افراد مجاز قابل دسترسی باشد. سامانه ثبت کامپیوتری بایستی طوری برنامه ریزی شده باشد تا از ثبت دوباره و چندباره بیمار از نقاط مختلف کشور جلوگیری کرده ولی همزمان وارد کردن سایر اطلاعات همچون وضیعت بیمار، نوع پروسیجر( اندوسکوپی، کلونوسکوپی، بیپوسی کبد و ...) ممکن باشد. فرم نیز بایستی طوری طراحی گردد که تمامی اطلاعات لازم و مهم بیماری در آن درج گردد. فرد یا افرادی مطلع و متخصص بایستی به جهت ارزیابی اطلاعات وارد شده به شکل مستمر سامانه را پایش نمایند و در صورت وجود هر گونه ابهام با مرکز مربوطه و فرد تکمیل و یا ثبت کننده فرم صحبت نموده و یا در صورت لزوم با بیمار مذاکره شده و یا پرونده پزشکی وی را بررسی نمایید. به جهت ارزیابی کیفیت جمع آوری اطلاعات به شکل تصادفی پرونده وفرم بیماران انتخاب شده مورد بررسی قرار گرفته و در صورت لزوم با بیمار نیز مذاکره شود.